Le Musée de la Pêche est notamment connu pour avoir accueilli un savoir-faire d'excellence : le maquettisme. Dès l'ouverture du musée, des maquettes de bateaux ont été présentées au public. Elles étaient commandées et achetées par le musée ou lui était données. A partir de 1977, un atelier, créé par la volonté du directeur Hervé Gloux, a fait rayonner l'institution muséale grâce à la qualité de ses maquettes et dioramas. Ces réalisations sont aujourd'hui au cœur du parcours permanent. 

Les bateaux représentent le cœur battant des collections du Musée de la Pêche. Ils sont les témoins matériels des mutations des pratiques et des techniques de pêche à travers les siècles. Que ce soit sur le territoire européen ou ailleurs, la modernité a fortement et durablement impacté la manière dont l'activité halieutique s'organise. La tradition a été progressivement remplacée ou du moins été modifiée à l'ère contemporaine. 

Voici une petite sélection de quelques bateaux du musée ou de maquettes représentatives.