A partir des années 1890, Jean Baffier mène de front ses travaux de sculpteur et une activité intermittente, dans des associations comme les "Gâs du Berry", et plus tard la "Fédération régionaliste française", ou dans des débats idéologiques, voire politiques. En 1902, il se présente aux élections législatives dans la circonscription de Saint-Amand, sous l’étiquette de la Ligue de la patrie française, un mouvement anti-dreyfusard. En 1908, il est candidat à un siège de conseiller municipal dans le 14e arrondissement de Paris. Son activité de polémiste l’amène à participer à diverses publications, dont le périodique "Le Réveil de la Gaule", qu'il anime de 1889 à 1912.

Personnage paradoxal, républicain et régionaliste, mais prônant un pouvoir fort, opposé à l’académisme, aux influences latines et méditerranéennes, à la modernisation, source d’uniformité, et même à l’instruction publique, militant pour le corporatisme, pour le maintien des particularismes régionaux et des traditions rurales, agricoles, familiales, Jean Baffier a beaucoup écrit et manifesté un talent incontestable pour l’organisation d’événements et l’animation de réseaux.