Le Muséum d'Histoire Naturelle de Blois, créé par la Société d'Histoire Naturelle et d'Anthropologie de Loir et Cher entre 1881 et 1903, ouvre ses portes au public au Château de Blois le 3 mai 1903.

En 1910, la Société d'Histoire Naturelle fait don de l'ensemble de ses collections à la Ville de Blois.

Le Muséum est transféré dans l'ancien palais de l'Evêché entre 1912 et 1914. Toutefois son inauguration n'aura lieu que le 14 juillet 1922.

Un homme marque cette période : Camille Florance, Président de la Société d'Histoire Naturelle de 1901 à 1931, qui fait du Muséum d'Histoire Naturelle de Blois, l'un des plus importants de province.

En 1940, à la suite des bombardements de la ville, les collections sont remisées au Château, sous les combles de l'aile Gaston d'Orléans, où elles resteront pendant plus de 40 ans.

En 1981, la Ville décide la restauration des collections et leur transfert aux Jacobins, où le Muséum ouvre à nouveau ses portes au public en janvier 1984